内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用

来源 :华中农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jswlgx
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为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross, MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对7个甘蓝亚种共12个MAGIC亲本构建系统发育树。全基因组鉴定共获得7930个单拷贝基因,每条染色体上随机挑选1条单拷贝基因,采用PCR方法进行内含子扩增并测序,最终获得3427bp内含子长序列。运用邻接法构建系统发育树,可将甘蓝类
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