基于生物信息学方法对三阴性乳腺癌差异基因表达的分析

来源 :山西医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jianjian19527
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目的从分子层面分析研究三阴性乳腺癌(TNBC)的差异表达基因(DEGs),为其诊疗提供新的思路.方法在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的公共基因芯片数据库(GEO)中获取三阴性及非三阴性乳腺癌相关基因芯片数据,利用R软件筛选出二者的相关差异表达基因(DEGs),并利用DAVID在线数据库对上述基因数据进行相关基因功能富集分析.同时,通过String在线数据库构建蛋白互作网络(PPI).结果按设定参数-基因差异表达倍数>1.0,P<0.05,筛选出298个差异表达基因,其中上调差异基因121
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