二氢叶酸还原酶缺陷型中华仓鼠卵巢细胞偏爱密码子的研究

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangql133
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目的 研究二氢叶酸还原酶缺陷型中华仓鼠卵巢细胞(CHO dhfr-)的偏爱密码子.方法 建立CHO dhfr-细胞高丰度mRNA的cDNA文库,对该文库进行签定以获得合格的编码蛋白质的cDNA序列,统计密码子使用频率并与CUTG数据库中的中华仓鼠比较,同时对所获得的cDNA序列进行对应统计分析.结果 获得了50个合格的CHO dhfr-细胞高丰度蛋白的cDNA序列,与中华仓鼠密码子使用频率比较,除了Pro,Arg外,其余氨基酸的最高使用频率的密码子在CHO dhfr-细胞和中华仓鼠中都相同.同时根据对应分析确定了能解释最多变量(14.7%)的第一主成分,确定了22个同义密码子为CHO dhfr-细胞偏爱密码子.结论 CHO dhfr-细胞存在自身偏爱的密码子,提示密码子的偏爱性是不同哺乳动物细胞功能差异的因素之一,也为外源基因在CHO dhfr-细胞中通过优化密码子而获得高表达提供了新思路.
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