基于4D label-free技术的水稻成熟种子蛋白质组学研究

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【目的】从蛋白水平揭示水稻种子成熟的分子基础,探究调控水稻种子成熟的关键蛋白和代谢通路。【方法】选用授粉后30d的成熟水稻种子,利用4Dlabel-free定量蛋白质组学进行质谱鉴定,通过生物信息学技术分析蛋白的亚细胞定位、结构域、GO注释和KEGG通路注释。【结果】总共鉴定了3484个种子成熟期的蛋白,相对分子质量大多在10000~100000之间,主要分布于细胞质、细胞核、叶绿体、线粒体和质膜上;结构域主要涉及蛋白质翻译的RNA识别基序和蛋白磷酸化修饰的蛋白激酶结构域;GO分析表明,成熟种子的蛋白主要参与了细胞过程和代谢过程,主要涉及催化活性和结合等功能,大多分布在细胞、细胞组分、细胞器和细胞膜等部位;KEGG分析发现,蛋白主要富集在核糖体、内质网中的蛋白质加工、氧化磷酸化和糖酵解等途径,推测蛋白质的翻译、加工和能量代谢是水稻种子成熟期的主要分子事件;进一步,鉴定了脱落酸(Abscisicacid,ABA)信号和吲哚乙酸(Indoleaceticacid,IAA)代谢的相关蛋白,同时也发现了NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)家族的转录因子。【结论】贮藏物质的积累和能量代谢是水稻种子成熟期的典型特征,ABA和IAA信号途径参与了种子成熟过程。
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