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黑曲霉（Aspergillusniger）作为重要的工业发酵菌株，被广泛用于多种有机酸和工业用酶的生产。随着组学技术的日益发展和成熟，黑曲霉的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等组学数据不断增长，宣告着黑曲霉生物过程研究大数据时代的到来。从单一组学的数据分析、多组学的比较到以基因组代谢网络模型为中心的多组学整合研究使人们对黑曲霉高效生产机制的理解不断深入和系统，这为通过遗传改造和过程调控对菌株的生产性能进行理性的全局优化提供了可能。文中回顾和总结了近年来黑曲霉的组学研究进展，并提出黑曲霉组学研究未来与过程优