【摘 要】
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Oxford Nanopore Technologies (ONT)公司开发出了商业化的纳米孔测序仪—MinION。相对于二代测序技术平台，MinION的主要特点是读长长、简单快速、便携性高且可以实时分析测序数据。各国的研究人员也已经逐步将MinION应用于病毒检测、病毒全基因组测序、新病毒的发现、病毒准种与进化研究等领域。本文回顾了近几年纳米孔测序技术在病毒基因组研究中的应用，讨论了病毒基因组测
【机 构】
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102206 北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,102206 北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,
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Oxford Nanopore Technologies (ONT)公司开发出了商业化的纳米孔测序仪—MinION。相对于二代测序技术平台，MinION的主要特点是读长长、简单快速、便携性高且可以实时分析测序数据。各国的研究人员也已经逐步将MinION应用于病毒检测、病毒全基因组测序、新病毒的发现、病毒准种与进化研究等领域。本文回顾了近几年纳米孔测序技术在病毒基因组研究中的应用，讨论了病毒基因组测序目前存在的问题，并展望了纳米孔测序技术未来的发展前景。
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从基础研究、关键技术与产品开发及典型应用示范三个层面阐述了我国在新发突发病原体及其传染病防控等方面所取得的最新科技进展，并对未来科技发展方向进行了展望。
目的对2016年台州市本地暴发的登革热病例进行实验室检测与溯源分析。方法采集3例患者急性期血清进行抗原、抗体和核酸检测，并用C6/36细胞分离培养登革病毒。用RT-PCR方法扩增全长E基因，测定序列并绘制系统进化树。结果从患者血清中检测到登革I型病毒核酸、IgM抗体和NS1抗原。成功分离到3株I型登革病毒株，这3株病毒在同一进化分支上，属于I型登革病毒中的Genotype I亚型，核苷酸同源性均为
目的探索云南地区蝙蝠携带的新型汉坦病毒。方法本研究于2016年7～8月在云南普洱地区采集到84只蝙蝠，利用病毒宏基因组学分析蝙蝠携带病毒种类，采用巢式或半巢式PCR鉴定汉坦病毒。采用MegAlign进行同源性分析，使用MEGA6.0进行序列比对及系统进化分析。结果本研究在小蹄蝠体内发现了1株汉坦病毒，命名为DodeHV，阳性标本均为小蹄蝠，通过PCR筛查发现在小蹄蝠中阳性率为5.97%(4/67)
目的观察对比流感病毒唾液酸a2，3-半乳糖(SAa2，3-gal)和唾液酸a2，6-半乳糖(SAa2，6-gal)受体在哮喘小鼠气道组织中的分布和表达以及地塞米松干预对其表达的影响。方法30只BALB/c小鼠被随机分成正常组(N组)、哮喘组(A组)和地塞米松干预组(D组)。A组小鼠以卵蛋白(OVA)致敏后激发建立哮喘模型，D组激发前腹腔注射地塞米松，余同A组。行BALF细胞计数，ELISA测定BA
目的阐明不明原因发热(fever of unknown origin，FUO)的血液样本中用常规方法难以检测到的潜在病原。方法利用二代测序技术序列非依赖的特性对病原核酸进行随机捕获，随后采用多重链置换扩增(multiple displacement amplification, MDA)方法进行富集。在得到测序结果后，进行宏基因组数据分析，构建进化树，最终实现对未知病原的鉴定。结果对10份不明原因
目的分析3株甲肝病毒(hepatitis A virus, HAV)流行株全基因组和准种序列特征。方法收集某地3例急性期甲肝患者血清标本，经病毒核酸提取、逆转录、分段巢式PCR，获得HAV近全长序列，并对全长VP1-2 A区进行克隆测序。结果VP1-2 A连接区分型结果表明3株HAV均属于IA亚型，3株序列在此区核苷酸和氨基酸同源性为100%；全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为99.9%～100%
目的从禽流感H5N1患者体内筛选分离抗流感病毒血凝素(Hemagglutinin，HA)广谱中和性抗体。方法通过B细胞体外培养、抗体可变区基因筛选及表达等技术，建立H5N1患者外周血中交叉反应性B细胞及H5N1假病毒中和活性B细胞的抗体基因文库。利用293T细胞表达系统体外表达抗体库，使用ELISA及假病毒中和试验筛选潜在的广谱抗体，并鉴定其功能。结果获得由VH1-2编码的抗体基因，其编码抗体可广
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目的了解门诊和住院儿童急性呼吸道感染病例中呼吸道病毒和肺炎支原体、衣原体的流行特征，为防控急性呼吸道感染、指导临床用药奠定基础。方法采集2011—2013年杭州某儿童医院呼吸道门诊病例咽拭子、住院病例气管吸取物。采用实时荧光PCR方法，对收集到的样本进行呼吸道病毒和肺炎支原体、衣原体的核酸检测。结果本研究908例病例中，610例检出至少1种病原体，总的病原体检出率为67.2%(610/908)，住
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