山药DoARID4基因克隆与表达特异性分析

来源 :西北农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lilunallen
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以‘铁棍山药’为材料,根据同源克隆的方法获得‘铁棍山药’DoARID4 序列,并对其氨基酸序列进行生物信息学分析,并构建系统进化树,通过 qRT-PCR试验对该基因进行初步的组织特异性表达分析初步探究DoARID4 在‘铁棍山药’生长发育以及扁茎发生中的调控作用,为 ARID基因家族的进一步研究提供理论依据.结果表明,克隆得到一条长 731 bp的条带,将测序结果进行 Blast比对,发现其与芋头、莲藕 ARID4序列相似性最高,因此将该基因命名为DoARID4 .DoARID4 可编码 211 个氨基酸,其蛋白质分子质量为23.73 ku;其蛋白分子式为C1035 H1606 N304 O305 S17 ,是一种脂溶性很强、非跨膜、亲水性蛋白;可能分布于细胞核及线粒体中,并且可能通过丝氨酸或苏氨酸磷酸化进行细胞信号的传导功能.DoARID4 在地上茎与地下茎的相对表达量较高,而在叶片中相对表达量较低,推测DoARID4 在山药茎和根的畸形发育中发挥重要作用.
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