论文部分内容阅读
目的
筛选结直肠癌相关的肿瘤标志物。
方法收集20例结直肠癌组织及配对的正常结肠黏膜上皮组织，分别采用激光捕获显微切割技术切割纯化结直肠癌细胞和正常结肠黏膜上皮细胞；应用基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记定量蛋白质组学方法分析鉴定结直肠癌和正常结肠黏膜之间差异表达的蛋白质；借助生物信息学工具对差异蛋白进行功能聚类分析。
结果共鉴定得到137个在结直肠癌和正常结肠黏膜之间差异表达的蛋白质，其中67个蛋白在结直肠癌中的表达上调，70个蛋白在结直肠癌中的表达下调。对差异蛋白进行功能通路分析，得到了7个高可信的功能网络，包括细胞生长增殖、氨基酸代谢、炎症反应、胚胎发育、细胞分化、分子转运及细胞骨架的构成。
结论基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记定量蛋白质组学方法是筛选结直肠癌肿瘤标志物的有效策略。