【摘 要】
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为了保护和利用蓝塘猪种质资源,采用Illumina CAUPorince 50K SNP芯片对139头蓝塘猪进行遗传群体结构分析。结果显示,SNP芯片基因型分型的平均检出率高达98.24%,表明该芯片适
【机 构】
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中山大学生命科学学院/有害生物控制与资源利用国家重点实验室,紫金东瑞农牧发展有限公司,广东壹号食品股份有限公司
【基金项目】
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国家科技基础性工作专项（2014FY120800）, 广东省扬帆计划项目（2014YT02H042）, 广东省生猪产业创新团队建设项目（2017LM1137）, 广东省科技计划项目（2014B020202001）
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为了保护和利用蓝塘猪种质资源,采用Illumina CAUPorince 50K SNP芯片对139头蓝塘猪进行遗传群体结构分析。结果显示,SNP芯片基因型分型的平均检出率高达98.24%,表明该芯片适合应用于中国地方猪。蓝塘猪的平均遗传距离值为0.3326±0.0339,主成分分析和G矩阵结果表明部分种猪之间亲缘关系较近。139头蓝塘猪种猪可以分成5个家系,分别为家系A、B、C、D和E,其中家系A、B、C和D均有种公猪。蓝塘猪的Y染色体共有两种单倍型,其中家系A和B属于单倍型A,家系C和D属于
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