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β-葡萄糖苷酶能够水解多种β-葡萄糖苷。它与其他纤维素酶共同作用，可以将自然界中含量丰富的纤维素水解成人类可以直接利用的能源物质——葡萄糖；β-葡萄糖苷酶在医学上也有重要的应用，它可用于一些肿瘤疾病的诊断和治疗。人缺乏β-葡萄糖苷酶，可以引起葡萄糖苷-N-脂酰鞘氨醇在巨噬细胞溶酶体内积累，引发戈谢病(Gaucherdisease)。