杨树WRKY基因家族鉴定及其干旱胁迫响应模式分析

来源 :中国细胞生物学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nikun0081
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
WRKY是近年来研究较广泛的植物转录因子,其序列的氨基(N)末端含有高度保守的七肽WRKYGQK,能够与顺式作用元件W盒[(T)(T)TGAC(C/T)]发生特异性结合,从而调控下游靶基因的表达。该研究利用生物信息学方法,对杨树WRKY转录因子进行了序列鉴定、结构分析、染色体定位、结构域分析、系统进化分析和胁迫响应模式分析,鉴定出杨树WRKY基因家族有122个成员,分为3大类(34个I类成员、78个II类成员和10个III类成员); WRKY基因染色体定位分析发现,位于每条染色体的数目各不相同,并且在9号染色体上没有分布,表明WRKY基因在染色体上呈现出不均匀分布;系统发育分析表明, WRKY家族成员形成3个主要进化支,此外,结合基因结构分析发现,位于相同进化支的WRKY基因通常具有相似的基序组成和外显子/内含子结构模式,表明WRKY基因的功能相似性;转录组分析发现, 62个家族成员表现出上调或下调的差异表达,可将其划分为5个基因聚类(I、II、III、IV、V),其中I、III、IV、V这4个聚类中绝大多数基因在干旱胁迫8 h左右表现明显上调, II类在干旱胁迫2~4 h表现明显上调,而PtWRKY70、PtWRKY81、PtWRKY104、PtWRKY108等在干旱胁迫处理后开始明显下调,表明WRKY基因在响应干旱胁迫的过程中具有重要作用。通过上述研究,极大丰富了杨树WRKY基因家族以及其应对干旱胁迫的功能,并为杨树抗旱育种计划提供了候选基因。
其他文献
<正>在为孩子挑选玩具时,你是否发现女孩玩具和男孩玩具泾渭分明?给孩子挑选玩具需要严格按照性别来吗?据新加坡《联合早报》报道,新加坡科技学院助理教授林竖美表示,所谓的
目的 探讨外侧盘状半月板的MRI分型特征及不同类型盘状半月板撕裂的发生率。资料与方法 将 89例MRI表现典型的外侧盘状半月板分作两组 ,即未成年组和成年组 ,其中未成年组
目的:比较并评价选择性痔上黏膜切除术(tissue-selecting therapy stapler,TST)与吻合器痔上黏膜环切术(procedure for prolapse and hemorrhoids,PPH)治疗Ⅲ、Ⅳ度痔临床疗
<正> 英国《BARTLES》公司研制成功一种横流皮带选矿机,已应用于生产。一、用途横流皮带选矿机是以重力选矿原理进行设计的,可选别150—5微米的微细物料。该机设计牢固、运转
11月中旬刚刚结束,由于部分产区原料果缺乏,浓缩苹果汁加工厂已经或将陆续停机。据中国果汁网统计显示,目前停机的地区主要是江苏、宁夏的工厂,山东、辽宁的部分工厂也将停产
船舶消防设备对船舶应急状态下生命力有至关重要的作用。船舶海上事故的发生给国家和集体带来巨大的损失,也给遇难船员家属及亲人们带来巨大的痛苦和灾难。在海上船舶是船员
中职生正处于生理和心理快速发展的关键时期,随着网络时代的快速发展,青春期的孩子对于网络缺乏较强的自控能力和自律意识。研究网络文化对中职学生自律能力的影响及培养,是德育
<正> 国内外利用白僵菌防治松毛虫、玉米螟等农林害虫均有许多成功的报道。1973年以来我们在省茶树病虫害生物防治协作组的指导下利于“903”白僵菌防治茶小卷叶蛾亦获得良好
本文通过分析网络营销在连锁经营中的应用,总结出网络营销与连锁经营结合起来会促进企业向多功能、综合服务的方向发展,并给企业带来增强其竞争实力,降低其营销成本,提升其企