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目的：探讨影响真菌微卫星聚合酶链反应（SSR—PCR）的多个因素，建立PCR的最佳反应体系，为进一步进行真菌的鉴定、遗传多样性研究奠定基础。方法：利用正交设计，从TaqDNA聚合酶、模板DNA、dNTP、引物4种因素，对真菌微卫星反应体系进行优化分析，并确定PCR适宜的退火温度及循环次数。结果：各因素的不同水平对PCR结果都有显著影响，其中模板DNA影响最大。在PCR反应体系中（25μL），TaqDNA聚合酶1U，模板DNA30ng，dNTP150μmol·L^-1，引物0．25μmol