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本研究对源自于啤酒厂的有害菌进行PCR鉴定，挑选具有典型特征的啤酒有害菌一短乳杆菌初步建立荧光原位杂交技术的检测方法，并对实验方法进行优化；进一步将荧光原位杂交和荧光微菌落结合的快速检测技术，通过荧光显微镜观察并计数，根据荧光探针与羧基二乙酸荧光索（CFDA）染料所被激发的不同颜色的荧光来定性及定量分析啤酒厂生产过程中的有害菌。并对啤酒酿造过程中的关键控制点使用FISH技术（以短乳杆菌为例）跟踪检测，建立啤酒中污染有害菌的溯源体系。