生命金属寡核苷酸螯合物的制备及反应机理

来源 :中南工业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xieqi509
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制备了5′端共价连接EDTA的寡聚核苷酸与生命金属的螯合物ODN-5′-EDTAM(n+),其中M(n+)为Fe(Ⅱ),Co(Ⅱ)或Cu(Ⅱ);分析、计算了这3个螯合物形成的最佳pH值范围,ODN-EDTAFe(Ⅱ)为pH5.8~8.6,ODN-EDTACo(Ⅱ)为PH4.6~8.1,ODN-EDTACu(Ⅱ)为pH3.4~5.7;在此条件下,剪切反应必须的Mg2+并不与Fe(Ⅱ),Co(Ⅱ)或Cu(Ⅱ)竞争EDTA,也不会形成沉淀;讨论了ODN-EDTAM(n+)切割DNA双链的反应机理:修饰寡核苷酸通过氢键在DNA双链的大沟结合形成三链体,在O2和还原剂DTT作用下,Fe作为催化剂,产生羟基自由基,氧化糖环,切割EDTAFe(Ⅱ)附近的DNA双链. The chelate ODN-5’-EDTAM (n +), which is a 5 ’end covalently attached to the oligonucleotide of EDTA and living metal, was prepared in which M (n +) was Fe (Ⅱ), Co Ⅱ). The optimum pH range for the formation of these three chelates was calculated and analyzed. The ODN-EDTAFe (Ⅱ) was pH5.8 ~ 8.6 and the ODN-EDTACo (Ⅱ) , ODN-EDTACu (Ⅱ) is pH3.4-5.7. Under these conditions, Mg2 + necessary for the cleavage reaction does not compete with Fe (Ⅱ), Co (Ⅱ) or Cu (Ⅱ) The formation mechanism of ODN-EDTAM (n +) cleavage of DNA double strand was discussed. The modified oligonucleotide formed triplex by the hydrogen bond in the major groove of DNA double strand. Under the action of O2 and reducing agent DTT, Fe As a catalyst, a hydroxyl radical is generated, the sugar ring is oxidized, and the DNA double strand in the vicinity of EDTAFe (II) is cleaved.
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