【摘 要】
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为阐明杆状病毒几丁质酶基因(v-ChiA)密码子使用在病毒基因组进化的基因水平转移中发生的适应性变化,比较分析了杆状病毒v-ChiA与昆虫几丁质酶基因(Chi-h、沙雷氏菌几丁质酶
【机 构】
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沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁省昆虫资源工程技术研究中心,沈阳110866
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为阐明杆状病毒几丁质酶基因(v-ChiA)密码子使用在病毒基因组进化的基因水平转移中发生的适应性变化,比较分析了杆状病毒v-ChiA与昆虫几丁质酶基因(Chi-h、沙雷氏菌几丁质酶基因(ChiA)以及杆状病毒以lef-8、lef-9和polh/ gran基因为代表的基因组(表示为le-lef9-pg)的密码子使用模式.结果表明,杆状病毒v-ChiA与昆虫Chi-h的GC含量、GC3s含量、有效密码子数(ENc)及与沙雷氏菌ChiA的GC含量均无统计学差异(P＞0.05);与杆状病毒lef8-lef9-pg的GC含量、GC3s含量、ENc值以及沙雷氏菌ChiA的GC3s含量、ENc值均有统计学差异(P＜0.05).杆状病毒v-ChiA与lef8-lef9-pg、昆虫Chi-h和沙雷氏菌ChiA的同义密码子使用均高度相似(相似性系数分别为0.992、0.870、0.862).选择与突变共同影响杆状病毒v-ChiA和lef8-lef9-pg的密码子使用,而昆虫Chi-h和沙雷氏菌ChiA的密码子使用完全由选择所影响.综上所述,杆状病毒v-ChiA的碱基组成及密码子偏好性与昆虫Chi-h相似,与lef8-lef9-pg不同;密码子使用的影响因素与lef8-lef9-pg相似,与昆虫Chi-h和沙雷氏菌ChiA不同.上述结果从密码子使用角度证实了杆状病毒v-ChiA来源于昆虫Chi-h的水平转移.
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