紧密连接蛋白claudin-14基因5’调控区序列的生物信息学分析

来源 :新乡医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lingotest
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的研究紧密连接蛋白claudin-14基因转录调控机制,并对潜在的转录因子结合位点进行分析。方法利用局部序列比对基本检索工具(BLAST)比对获得claudin-14基因5’调控区序列;利用模序识别分析TATA-box、GC-box和CAAT-box;利用在线分析软件Neural Network Promoter Prediction和PROMOTER 2.0分析claudin-14基因5’调控区序列中启动子;利用在线分析软件EMBOSS和CpG Island Searcher分析claudin-14基因5’调控区序列中CpG岛位置;利用在线分析软件TFSEARCH分析claudin-14基因5’调控区序列中潜在的转录因子结合位点。结果 Claudin-14基因5’调控区序列中存在1个CAAT-box、1个TATA-box和1个GC-box;claudin-14基因可能存在5个启动子位点;CpG岛位于62 bp区间(229~290 bp)、99 bp区间(417~515 bp)、76 bp区间(523~598 bp)、89 bp区间(836~924 bp)、69 bp区间(1 216~1 284 bp)和194 bp区间(1 235~1 428 bp)。评分在85分以上时,该区域有432个潜在的转录因子结合位点;评分在90分以上时,该区域有156个潜在的转录因子结合位点;评分在95分以上时,该区域有66个潜在的转录因子结合位点;评分在100分时,该区域有24个潜在的转录因子结合位点。结论 Claudin-14基因可能存在不同的转录起始位点;claudin-14基因的转录受DNA甲基化和多种转录因子的调控。
其他文献
<正>为探索新的抗癌药物,采用新型微生物类细胞培养法,对猕猴桃、铁登台、三棱剑、白花菜、野蜓蛐1 号、野蜓蚰2号6种壮族民间中草药进行了初步抗肿瘤作用筛选,结果铁登台、
会议
<正>在通常情况下,根据报酬本身对员工所产生的激励是一种来自外部的强化,还是一种来自内部的心理强化,报酬可以分为外在报酬和内在报酬。外在报酬主要指企业提供的基本工资
水利事业关系到国民经济的基础命脉,是我国社会主义建设中非常重要的一项事业。抓好建设管理中的关键问题,才能更好的进行水利工程建设管理。笔者总结改革开放多年来水利事业
根据通信网络技术的相关理论与应用现状,针对光纤通信技术进行分析,着重阐述通信网络核心技术中的光纤通信技术分类,并对光纤未来发展趋势进行了分析,最后提出几点思考,对光
处方:蝉蜕20只。用法:加水1碗半,煎至半碗,冲米酒1两内服(不能喝酒者,酒量可酌减)。疗效:治疗10余例,均愈。病例:xx,34岁。产后3天胎盘仍不下,腹部胀痛。经服上方15分钟后胎
目的:探讨接受夫精人工授精治疗患者(undergone Intra UterineInsemination IUI)的心理健康状态及在夫精人工授精周期中性激素浓度的变化,分析人工授精技术本身是否影响患者
商用物业在房地产发展和开发中占据非常重要的位置,未来势必将成为我国房地产开发的一个重要方向;目前,已经有很多的投资商和房地产公司都开始重视并涉足这一领域。但是商用
本文通过对工程实列的设计举证,总结了幕墙变形缝设计的基本原则和设计方法,对后续幕墙工程的变形缝设计有借鉴和抛砖引玉的作用
目的:比较分析腹腔镜与开腹手术治疗急性结石性胆囊炎的临床疗效。方法:计算机检索120例急性结石性胆囊炎患者,随机分为试验组与对照组,每组60例。给予对照组患者传统开腹手
本文首先论述了我国地勘单位改革发展的历程,并从多个方面对地勘单位存在的主要问题进行剖析,结合三0三大队的实际情况,然后有针对性阐述独到的见解,指明了深化地勘单位改革