蛋白质在溶液中构象转换的分子动力学模拟

来源 :石河子大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：aoli668

【摘要】

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将蛋白质的稳定和失活、折叠和去折叠等现象概括为蛋白质分子在溶液中的构象变化问题.采用非晶格模型和Langevin分子动力学方法研究了无限稀释溶液及不同尺度和不同表面亲/疏

【作者】

：

卢滇楠刘铮

【机构】

：

清华大学化学工程系

【出处】

：

石河子大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2005年6期

【关键词】

：

蛋白质折叠蛋白质稳定化非晶格模型 Langevin分子动力学限制性空间 protein folding protein stabilization o

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将蛋白质的稳定和失活、折叠和去折叠等现象概括为蛋白质分子在溶液中的构象变化问题.采用非晶格模型和Langevin分子动力学方法研究了无限稀释溶液及不同尺度和不同表面亲/疏水性球形限制性空间内β模型蛋白的构象分布及其转换特性.模拟结果显示:尺寸适度的疏水性空间有利于蛋白质结构发生缩塌,而亲水性空间有利于缩塌态蛋白质结构的稳定,且表面亲/疏水性的影响作用随着空间半径的增大而减弱.计算结果与实验报道一致,为研究蛋白质分子在溶液中的折叠和稳定化提供了理论工具.

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