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运用RAPD分子标记技术分析了来自云南各地24个烟草赤星病菌株的遗传多样性。结果表明。12个随机引物共扩增出了145条DNA条带，所扩增出的DNA条带均为多态带，表明云南烟草赤星病菌存在丰富的遗传多样性。不同地点赤星病菌的遗传结构之间都有一定的差异，生态环境相似性越大的地点，赤星病菌的遗传结构相似程度就越高。赤星病菌的遗传结构也随寄主品种（基因型）的不同而表现出一定的差异，寄主品种的遗传背景影响着赤星病菌的遗传结构。