采用柔性分子对接技术模拟蛋白质在疏水作用色谱上的保留行为

来源 :中国科学(B辑:化学) | 被引量 : 0次 | 上传用户：thonary09

【摘要】

：

将蛋白质与疏水作用色谱(HIC)固定相相互作用分为直接非键/构象作用和蛋白质表面疏水效应两个热力学过程,从而定量给出了处于浓盐析盐水溶液中HIC保留时间与配基/蛋白质结合自由能之间的二元线性关系.通过ICM柔性分子对接策略及遗传算法(GA)对27个已知晶体结构的蛋白质与疏水配基的可能结合方式进行模拟和分析,所得结果与实验观测情况吻合良好.研究表明,蛋白质局部疏水效应以及配基与蛋白质的非键/构象作用

【作者】

：

周鹏田菲菲李志良

【机构】

：

重庆大学化学化工学院,重庆大学化学化工学院,重庆大学化学化工学院,化学生物传感与计量学国家重点实验室长沙410082,,重庆400044,重庆400044,重庆400044

【出处】

：

中国科学(B辑:化学)

【发表日期】

：

2007年03期

【关键词】

：

疏水作用色谱柔性分子对接遗传算法蛋白质盐溶因子

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