应用微阵列芯片技术分析先天性巨结肠微小RNAs表达谱差异

来源 :中华实用儿科临床杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qzl11320583407
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目的

检测先天性巨结肠(HSCR)微小RNA(microRNAs,miRNA)表达谱,并探讨差异表达的miRNAs在HSCR发生中的作用。

方法

收集27例HSCR患儿的狭窄段及扩张段肠管组织,选取其中6例,应用miRNA芯片技术筛选HSCR的miRNAs表达谱。运用生物信息学软件预测miRNAs靶基因,采用实时荧光定量(qRT)-PCR验证miR-145-3p、miR-4505及miR-1260a在27例HSCR狭窄段和扩张段组织的表达差异。

结果

与扩张段肠管组织相比,狭窄段肠管表达上调超过2倍的miRNAs有19个,表达下调超过2倍的有7个(P均<0.05)。利用靶基因预测软件找到了miRNAs的靶基因,如SOX10、RET、L1CAM。qRT-PCR证实不同组间miR-145-3p(狭窄段1.42±0.42比扩张段0.90±0.31)及miR-4505(狭窄段1.30±0.30比扩张段0.76±0.22)表达量差异具有统计学意义(P均<0.001),且不同分型之间miR-145-3p(长段型1.53±0.46比短段型1.16±0.12)及miR-4505(长段型1.42±0.26比短段型1.00±0.16)的表达量差异均具有统计学意义(P均<0.001),而miR-1260a(狭窄段1.11±0.25比扩张段0.99±0.21)的表达差异无统计学意义(P=0.064)。

结论

HSCR病变段及扩张段肠管存在miRNAs表达差异,miR-145-3p和miR-4505可能与HSCR的发病密切相关。

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