基于全基因组重测序构建西瓜高密度遗传 图谱和果实相关性状的基因定位

来源 :中国瓜菜 | 被引量 : 0次 | 上传用户:TSSSSSS
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的与意义:遗传图谱是进行重要农艺性状QTL/基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种等工作的重要工具。長期的人工选择使得栽培种西瓜的遗传基础进一步狭窄,使得高效可获得的分子标记成为限制西瓜高密度遗传图谱构建的重要因素。随着高通量测序技术的发展和西瓜参考基因组草图的组装完成,通过测序获得大量分子标记以构建高密遗传图谱成为可能。通过全基因重测序构建高密度遗传图谱,可以更快更准确的检测重组断点,开发大量适于遗传图谱构建的分子标记。最近几年,陆续有多张西瓜遗传图谱发表。但这些图谱大都基于简化基因组测序,遗传图谱的饱和度相对不足;作图群体多为临时性分离群体,不能进行重复试验,影响后续基因定位工作的准确性。笔者构建了重组自交系作为永久性作图群体,通过对其进行全基因组重测序构建了一张西瓜高密度遗传图谱,并对果皮颜色、种皮颜色和果实苦味3个性状进行了初定位,以期用于西瓜分子遗传育种等工作。
  材料与方法:以具有显著性状差异的自交系材料‘9904’和‘Handel’为亲本,经过连续7代自交,构建了含126个单株的重组自交系。‘9904’具有墨绿色果皮、浅黄色种皮、苦味果实; ‘Handel’具有浅绿色果皮、黑色种皮、无苦味果实。采集西瓜植株幼嫩叶片,提取植物基因组DNA,质量检测合格的DNA将用于测序建库。高质量的DNA被随机打断为200~500 bp的片段,然后经过DNA片段末端修复、3’端加A、添加测序接头和进行纯化、最后经PCR扩增等完成测序文库的构建。文库经严格的质量检测后通过Illumina HiSeqTM测序平台进行测序。完成标记的填补和校正后,根据子代重组情况进行bin划分。将各样本按照染色体物理位置排列整齐,当任何样本出现分型转变时认为出现重组断点,然后将重组断点间的SNP化为一个bin中。同时对bin进行偏分离过滤,对严重偏分离的标记进行过滤(P
其他文献
自20世纪90年代初期“人文精神”讨论以来,类似“文学已死”的判决不绝于耳,这其中有知识分子(作家)对浮躁的、功利化时代的失望,乃至对文学产生了深度怀疑,似乎唯有宣布死亡,才能消除心头对严重的时代症结的怨艾。从中似乎也能看出知识分子(作家)某种“世纪末”的精神状态,道德理想主义与文学荣光的黯淡,使得他们陷入了一种怪圈。一方面似乎许多人有甘当殉道者的倾向;另一方面,他们依然在黑暗中寻找出路。然而,时
音乐核心素养的提高对于初中学生的成长和发展具有重要的作用和意义,不仅有利于发散学生音乐思维能力,還可以提高学生的音乐审美能力。然而,当前初中音乐教学当中所采取的教学策略已经无法实现培养学生的音乐核心素养了,因此,教师在实际的教学当中,有必要采取相关的音乐教学策略达到这一目的。初中阶段的学生无论是生理还是心理,都处于飞速发展的阶段,他们的情绪也十分容易出现波动,而通过音乐,可以有效地调节学生的情绪,
记者(以下简称记):近年来,随着市场的日益开放,企业对技术人才的需求大量增加,国家对职业教育也越来越重视。我们知道,杭州市余杭区劳动技工学校以先进的教育理念为指导,乘势而上,迅速发展,创职教品牌,在短短几年时间内学校规模由200 人增加到1000 多人,为社会输送了大批技能人才。请问贵校是如何在市场竞争中以创新树立品牌的呢?  孙永辉(以下简称孙):学校的产品是教育服务,学校的顾客就是学生、家长和
独自生活  我想,我從没有离开  屋后那片山林。多年来  所有别的地方都是它  所有的我,在此处,也在别处  习惯了在山林的庭院随意走动  记忆里,风通常有点大  叶子拍打着虚无  流水声忽远忽近  是单属于这里的萧瑟与清冷  坟茔里边的人  也不过是独自生活在别处罢了  比如我,你们始终难以完整地从人群中找到  如今我更偏爱沉默  很多事说与不说  区别并不大  改变是艰难的,也需要时机  午后
【摘 要】 教师要根据初中生的身心发展规律,利用心理学的知识,开展丰富多彩的德育活动,与学生平等地交往,调动学生的参与兴趣,促进学生的道德认知、情感、意志、行为的统一,促进学生的健康成长。  【关键词】 初中德育;德育活动;心理学  “德才兼备”自古有之,有德无才乃愚人,有才无德乃小人,教师不仅要培养学生的知识才干,还要改善学生的德行,让他们爱师孝亲,成为对社会有贡献的人。当前部分学生存在道德行
不同的学生有不同的特长,这和他们的生理特点、学习兴趣、学习层次息息相关。教师在开展体育教学时,要了解学生的学习特长,能够针对学生的特长制订分类教学的策略。教师只有开展这样的教学,才能够让学生觉得自己的特长可以被发挥,他们的学习成果可以被认可,从而他们才愿意参与体育训练。  一、根据学生的生理特点分类  在传统的体育教学中,教师经常会粗略地评估学生的生理特点,然后针对学生的生理特点来引导学生制订教学
目的与意义:番茄红素是一种强抗氧化剂,其抗氧作用是维生素E的100倍,西瓜中富含番茄红素,而且西瓜果实中的番茄红素鲜食即可被人体直接吸收而产生保健作用。有研究表明,三倍体无籽西瓜及同源四倍体西瓜的番茄红素、瓜氨酸和维生素C等次生物质含量显著高于其二倍体祖先。西瓜多倍体为什么会产生这些优势?其多倍体优势机制是什么?本研究通過对不同倍性西瓜果实发育不同时期番茄红素的积累差异、合成酶基因的表达差异和不同
在十九大报告中,国家将“农业现代化”列入党章,凸显了我国农业现代化发展是一种必然趋势。但传统农业向现代农业的转型中依旧面临着诸多问题,如生产者的受教育水平、生产经营结构的单一、农业基础设施薄弱、金融支持力度不足等等。就目前而言,金融借贷资金的支持对促进现代农业发展有重要作用。郭佳琳所著《金融借贷资金支持现代农业发展研究》一书,即是针对金融借贷资金如何支持农业现代化发展进行的全方面阐述,具有一定的学
六十年来,中国人的服装从单一质朴逐渐演变得多姿多彩,这不仅反映出人们对美有了更深的理解和追求,从社会意义上说,服装更是人们进行身份角色完美转换的必需品。本期《职业》专访TPO课题专家——刘瑞璞教授,带你一起回顾60年来的职场变装故事。    军服、警服的误会    通常人们所说的“职业装”分为制式和非制式两种。  制式职业装所指的是职业化很强的职能性服装,例如警服、军装、消防服等。  上个世纪80
众所周知,安稳的工作已经过时了。纽约Behance的首席执行长、创始人贝尔斯基说,做兼职──特别是在你一直想从事的创造性领域是一个赚些外快、未雨绸缪开始探索新工作机会的途径。该公司为创新性行业开发产品和网络工具。  不过在你的日程表中安排进兼职工作是需要计划的。如何开始呢?    不要重复你已经在做的工作     如果你在一家喜欢的公司里做程序员,每天工作8小时,那么在全职工作之外从事同样的编程工