【摘 要】
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药物分子对接是计算机辅助药物设计的主要方法之一.利用化学得分函数(Chemscore)作为能量函数,以及将一种新的优化算法-两层粒子群算法作为搜索算法,得到了一种新的计算机分
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药物分子对接是计算机辅助药物设计的主要方法之一.利用化学得分函数(Chemscore)作为能量函数,以及将一种新的优化算法-两层粒子群算法作为搜索算法,得到了一种新的计算机分子对接程序:tPSODock.利用tPSODock计算了100个蛋白质-配体的复合物,并且与Consdock和Autodock 3.0计算结果进行了对比,结果显示88%的计算结果RMSD小于2.0A,优于Consdock以及Autodock的计算结果.说明tPSODock在是一种高效的分子对接软件,可以用于大规模数据库的筛选工作,适合新药的开发和研制.
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