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根瘤菌系统发育地位的判断在根瘤菌新属种的确认中起重要作用.其中,16S rRNA序列分析是关键技术.然而,新近的研究对采用16S rRNA全序列推测的系统发育关系的准确性提出质疑.本实验室的工作表明基因组物理结构分析将能更客观反映其系统发育关系.基因组序列分析在帮助澄清某些根瘤菌属种的系统发育地位中也起重要作用.