【摘 要】
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目的 应用生物信息学软件预测分析结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv1733c的结构和功能.方法 采用生物信息学软件ORF Finder、Interproscan、SOSUI、Protpapram、ProtScale、Si
【机 构】
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石河子大学医学院病理生理学教研室/“新疆地方与民族高发病”教育部重点实验室,新疆石河子832002;石河子大学医学院第一附属医院急诊外科;石河子大学医学院第一附属医院神经外科;石河子大学医学院第一附属
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目的 应用生物信息学软件预测分析结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv1733c的结构和功能.方法 采用生物信息学软件ORF Finder、Interproscan、SOSUI、Protpapram、ProtScale、Signal IP、Tmpred、TMHMM、NetNGlyc、NetPhos 3.1 Servera、PSORT、WoLF PSORT、TargetP-2.0-CBS、NLStradamus、SOMPA、IEDB、SYFPEITHI、RANK-PEP、NetMHCIIpan、BLAST、STRING等对结核分枝杆菌Rv1733c蛋白的理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区、信号肽、糖基化及磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构、B细胞与T细胞抗原表位以及蛋白质的相互作用进行预测分析.结果 Rv1733c蛋白由210个氨基酸组成,分子式为C988 H1620N298 O 289 S5,原子总数3200,其编码基因全长633 bp,等电点10.31,不稳定性指数34.84,脂肪族氨基酸指数102.76,平均疏水性0.14.该蛋白有跨膜区无信号肽,有2个糖基化位点和13个磷酸化位点.该蛋白二级结构以α-螺旋(占41.90％)为主,结构较松散.其亚细胞定位于细胞质,非分泌蛋白,属于稳定的疏水性蛋白.RRv1733c蛋白含有7个B细胞抗原表位,多个T细胞表位.其互作蛋白分别为Rv2628、Rv1734c、Rv2627c、Rv0079、Rv1733c、h1rp1、esxA,并参与多种生物学过程.结论 生物信息学分析Rv1733c为稳定疏水性胞浆蛋白,含有多个T、B细胞抗原表位,能够磷酸化并与多种蛋白相互作用,可作为抗结核多肽疫苗的候选蛋白.
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