【摘 要】
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海洋微生物是新颖几丁质酶基因的重要来源。构建南海北部巴士海峡深海表层沉积物几丁质酶基因文库,得到几丁质酶氨基酸序列共计114条。以0.3的距离划分OTU,得到54个OTU单元,
【机 构】
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中国科学院南海海洋研究所/中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室
【基金项目】
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广东省自然科学基金博士启动项目(S2012040006215);广东省中国科学院全面战略合作项目(2012B091100276)
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海洋微生物是新颖几丁质酶基因的重要来源。构建南海北部巴士海峡深海表层沉积物几丁质酶基因文库,得到几丁质酶氨基酸序列共计114条。以0.3的距离划分OTU,得到54个OTU单元,丰富度指数Chao1值为159.86,多样性指数Shannon和Simpson值分别为3.39和0.06。对54条OTU单元的代表序列,利用BLAST程序与Gen Bank基因库中的序列比对,所有序列均发现具有几丁质酶基因的保守位点,相似性最高为97%,最低为41%,31个OTU单元的代表序列来自于未培养微生物。结果表明,在南海北部深海沉积环境中具有丰富的几丁质酶基因多样性,蕴藏着大量未知的几丁质酶基因资源。
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