幽门螺杆菌（Hp）的检测包括侵入性检测和非侵入性检测，其中侵入性方法需通过胃镜获取活组织进行检测，具有创伤性；包括快速尿素酶试验（RUT）、胃黏膜组织学检测、细菌培养和基因方法检测。而非侵入性检测不依赖胃镜检查，通过被检查者呼出的气体、粪便或血清即可完成检测；无创伤性或者是创伤性小危害很低；包括13C或14C尿素呼气试验（UBT）、粪便Hp抗原检测（HpSA）和血清Hp抗体检测。
　　各种检测方式的优劣势分析
　　侵入性检测方法
　　必须通过胃镜取胃部的活组织标本，胃镜下采样检测需要被检测者在胃镜检查时对胃黏膜进行采样后可通过胃黏膜组织学染色、细菌培养、快速尿素酶试验（RUT）或基因扩增进行幽门螺杆菌检测，其中基因扩增法灵敏度较高，结果比较可靠；快速尿素酶检测法最为简便、快速，但由于观察时间过短或受某些因素的影响常致结果不够可靠。
　　但是，胃镜下采样检测的最大问题在于胃镜检查给被检测者带来的痛苦和可能造成的胃部损害。而且胃镜、活检钳消毒不完全就可能引起乙型肝炎病毒等其他病原菌的传播可能。此外，胃镜检查操作还存在取材部位不准确带来的假阴性风险，费用也比较贵。而幽门螺杆菌局灶性分布也常导致漏诊问题。
　　非侵入性检测方法
　　相对比较简单方便，而且创伤性小，临床应用最为普遍。
　　血清Hp抗体检测的原理是人在感染幽门螺杆菌后会在体内产生相应的抗体，通过检测抗体来判断幽门螺杆菌感染情况。
　　但是，幽门螺杆菌感染后一般需要数月半年后抗体检测才会呈现阳性结果，因而在幽门螺杆菌感染初期的检测结果常为假阴性。而且根除Hp后抗体下降缓慢，患者往往需要半年以上抗体水平才会下降，即使检测出了Hp抗体阳性也只能说明被检测者曾经感染过幽门螺杆菌，并不能反映出Hp感染的当前状况。因此，血清Hp抗体检测法主要用于流行病学调查。
　　粪便Hp抗原检测的原理是幽门螺杆菌会通过宿主的消化道排入粪便，其中部分会裂解死亡，但绝大部分Hp抗原成分会保留下来，因此可以通过检测粪便中HP抗原情况，判断被检测者幽门螺杆菌感染情况。理论上讲该检测应该是能够证明Hp感染的直接证据，其准确性是毋庸置疑的，而且该检测方法无创，粪便标本容易获得，检测速度快，成本低。
　　但是，目前抗原测定结果准确性还不理想，而且需要收集样本后成批测量，不能及时获得报告结果，而且粪便的保存和处理都需要一定的条件支持，进口试剂的价格也比较贵，所以并没有得到广泛推广。
　　尿素呼气试验（UBT）——凭借其安全性高、准确度高、操作简单等优点，成为国际上公认的Hp诊断的“金标准”之一。尿素呼气试验只需要吹气5分钟就能获得检测结果，不会给被检测者带来其他任何伤害，且成功地避免了做胃镜时的种种不适感。