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区域创新体系的研究包括基本理论研究和实证研究。近期的理论研究主要包括区域创新体系的基本概念、结构、创新环境和体系的效能评价,实证研究在国外区域创新体系研究中占很大的比重。国内区域创新体系研究基本上保持了与国外先进研究相一致的步调。尽管区域创新体系理论发展很快,但一些基本概念仍存在较多争议,尚没有形成比较完整的、内部一致、逻辑严密的理论体系。