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对现有已知药物的功能模式进行分析，可以帮助发现其可能的新应用，指导联合用药或预测药物的未知毒副作用。提出将药物化学结构信息和GO注释信息结合，分析药物功能模式相似度。药物化学结构和GO注释信息下载自DrugBank数据库，其中GO注释信息包括生物过程、分子功能和细胞定位等3个分支。计算现有4886种药物的功能模式相似度，并对其进行聚类分析。基于Tanimoto系数计算药物化学结构相似度，基于语义分析计算药物GO注释中3个分支的相似度。分别使用Logistic回归、算术均值、几何均值将上述4个药物相似度结合