目的 研究黑色素瘤相关抗原1(MAGE-1)在中国肝癌患者中的表达,并阐明MAGE-1基因变异是肿瘤细胞内的突变还是单核苷酸多态性(SNP),以及基因变异在人群中的分布状况. 方法提取19例原发性肝癌(HCC)患者的癌组织、癌旁组织总RNA,用逆转录-多聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测组织MAGE-1基因mRNA的表达,并通过PCR产物测序分析编码基因是否存在变异;提取HCC患者癌组织、癌旁组织和外周血细胞基因组DNA,以及23例正常献血员外周血细胞基因组DNA,分析MAGE-1编码基因的变异状况并利用软件对变异抗原蛋白的生物学意义进行了初步探讨.结果癌组织中MAGE-1表达阳性率为47.4%(9/1 9),癌旁组织无表达.序列测定显示,MAGE-1 cDNA编码基因存在3种类型:一类是Ⅰ型(GenBank M77481),发生率为11.1%(1/9);另一类型(C159T,A272G,G393A)发生率为5 5.6%(5/9),称之为TGA型,导致编码的2个氨基酸的改变分别是T32A和R72Q;第三种类型(A272G,C991T,A1125G)发生率为33.3%(3/9),仅A272G引起一个氨基酸的替换(T32A),称之为GTG型.经对基因组DNA分析,证实以上3种基因类型不是肝癌组织的基因突变,而是SNP,其在肝癌患者和正常献血员中分布的比例分别为:Ⅰ型占26.3%(5/19)和60.9%(14/23);TGA型占57.9%(11/19)和47.8%(11/23),GTG型占21.1%(4/19)和21.7%(5/23).TGA型和GTG型的序列已被GenBank收录,编号为AF46351 5和AY148486.在男性研究对象中,SNP型别在是否患有HCC及是否表达MAGE-1抗原的患者中的分布差异均无显著性.SNP可能产生多个新的能与人白细胞抗原结合的抗原表位.利用多个模块从头搭建的方法,得到Ⅰ型和TGA型的蛋白三维空间结构模型.结论 MAGE-1在HCC患者的癌组织中表达,发现MAGE-1存在3种高频分布的SNP类型,尝试建立了MAGE-1蛋白的三维空间模型,这为进一步研究不同的MAGE1-1抗原性肽疫苗奠定了基础。
肝癌患者及正常人群中黑色素瘤相关抗原1的基因多态性
【摘 要】
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目的 研究黑色素瘤相关抗原1(MAGE-1)在中国肝癌患者中的表达,并阐明MAGE-1基因变异是肿瘤细胞内的突变还是单核苷酸多态性(SNP),以及基因变异在人群中的分布状况. 方法提取19例原发性肝癌(HCC)患者的癌组织、癌旁组织总RNA,用逆转录-多聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测组织MAGE-1基因mRNA的表达,并通过PCR产物测序分析编码基因是否存在变异;提取HCC患者癌组织、癌旁组
【机 构】
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221002,江苏,徐州医学院附属医院传染科,北京大学人民医院肝病研究所,广西桂林医学院,广西桂林医学院,北京大学人民医院肝病研究所,北京大学人民医院肝病研究所,广西桂林医学院,北京大学人民医院肝病研
【出 处】
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中华肝脏病杂志
【发表日期】
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2004年12期
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