修订后的预算法通过法律形式点明绩效管理的重要性，要求各级单位在预算管理中注意融入绩效理念，将绩效管理思想方法注入全面预算管理中，科学应用预算绩效评价结果，指导各级单位的预算工作。目前事业单位的预算绩效管理存在重视分配和支出而忽视管理和绩效的问题，预算绩效的激励约束作用不明显，在实际工作中，事业单位应当严格按照政府部门发布的实施预算绩效管理意见，构建清晰、全面的预算绩效管理体系，实现预算管理和绩效管理一体化。本文主要探究政府会计制度下事业单位预算绩效管理，首先从政府会计制度改革对预算绩效管理的影响入手，分析预算绩效评价标准以及对制度改革对单位预算绩效管理的实际影响，其次研究当前单位预算绩效管理中的问题，最后针对问题提出可行的应对策略，旨在于提升事业单位的预算绩效管理水准，助力政府部门推进的财政体制改革工作。