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从三套三系及它们的杂种共１０个水稻材料无菌苗叶片提取ＤＮＡ，用随机的ＤＮＡ引物分别做ＰＣＲ扩增（ＲＡＰＤ）。扩增产物在琼脂糖胶上电泳产生可重复的指纹图谱，４７％的引物产生的图谱可以把不育系和恢复系区别开来，它们各自的特异带可以作为品种鉴定的分子标记，同时这种标记能够用来检测亲本系间的遗传距离，从而为强优势组合的亲本选配提供分子水平的依据。