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采自河北承德11个表现矮花叶症状的玉米样品,用甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)和白草花叶病毒(Pennisetum mosaic virus,PenMV)简并引物扩增了基因组3’端约2.1kb的片段并进行测序.Blast结果表明其中8个样品含有PenMV.扩增到的PenMV序列均为2 135 nt,包括部分NIb基因(985 nt)、完整的CP基因(909 nt)和3’-UTR(241nt).这8个分离物CP基因和3’-UTR与GenBank上其他PenMV分离物相应序列的核苷酸一致率分别为89.8％～93.4％和95.9％～97.9％.根据扩增的2 135nt序列和CP基因序列构建系统发育树,8个分离物与GenBank上其他PenMV分离物都分为2个组:山西组和承德组.重组分析表明CD9的CP基因存在重组.