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用SSR标记对来自中国西南地区（四川、云南、贵州、重庆）的11份鸭茅种质的110个单株进行遗传多样性研究。结果表明，1）21对引物共扩增出多态性条带143条，平均每对引物扩增出6．8条，多态性条带比率（PPB）达90．7％；多态性信息含量（PIC）范围为0．17（A01F24）～0．45（A01E02），平均为0．33；Shannon多样性指数（Ⅰ）范围在0．0463～0．3477，表明供试鸭茅种质具有丰富的遗传多样性。2）AMOVA分析表明，63．93％的遗传变异存在于种质内部，种质间变异仅为21．93