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比较几种常用的社团结构分析方法,讨论它们在代谢网络分析中的不足之处。模拟退火算法在代谢网络模块分析中具有一定优势,选用该算法分析苏云金杆菌代谢网络巨强连通体中的功能模块,并将所得的结果与KEGG数据库中的途径信息进行对比研究,发现大部分的模块都对应于1~2个KEGG途径。进一步的研究表明这些模块均具备重要的生物学功能意义。