【摘 要】
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阐述了利用Level Set模型抽取并分析蛋白质分子场特征方面的工作.从蛋白质分子结构出发,基于分子力学和分子动力学理论计算得到蕴含丰富生化信息的分子场数据;设计了一种有效的Level Set模型揭示分子场能量突变区域;进而构造体特征函数,抽取并分析Level Set曲面的拓扑结构特征;最后对同一蛋白质不同状态下的Level Set曲面进行多属性比对.采用文中方法可成功地抽取蛋白质分子场的重要特征
【机 构】
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浙江大学CAD＆CG国家重点实验室,浙江大学数学科学研究中心
【基金项目】
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国家自然科学基金重点项目（60533050）,浙江省杰出青年团体项目（R407042）.致谢向对本文的工作给予很多支持和建议的老师和同学们,尤其是张涛、胡敏、王章野、王林聪表示感谢!
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阐述了利用Level Set模型抽取并分析蛋白质分子场特征方面的工作.从蛋白质分子结构出发,基于分子力学和分子动力学理论计算得到蕴含丰富生化信息的分子场数据;设计了一种有效的Level Set模型揭示分子场能量突变区域;进而构造体特征函数,抽取并分析Level Set曲面的拓扑结构特征;最后对同一蛋白质不同状态下的Level Set曲面进行多属性比对.采用文中方法可成功地抽取蛋白质分子场的重要特征,所抽取的特征与已有生物学结论一致,如DPS蛋白质与铁离子结合的空腔区域、HIV-1蛋白酶内部的水分子排
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