【摘 要】
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目的:应用基因芯片技术,研究喉鳞状细胞癌中miRNA的表达谱,筛选喉鳞癌和癌旁正常中组织差异表达的miRNA,寻找可能的分子生物学指标。方法:选取2008-06-01-2009-04-30中国医学
【机 构】
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深圳市第二人民医院; 深圳大学第一附院耳鼻喉科; 中国医学科学院肿瘤医院头颈外科; 中国医学科学院肿瘤研究所病因与癌变研究室;
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目的:应用基因芯片技术,研究喉鳞状细胞癌中miRNA的表达谱,筛选喉鳞癌和癌旁正常中组织差异表达的miRNA,寻找可能的分子生物学指标。方法:选取2008-06-01-2009-04-30中国医学科学院肿瘤医院8例喉鳞癌及其配对的癌旁正常组织(距肿瘤组织>1cm),Trizol法提取总RNA,经Cy3荧光标记后与含有人723条miRNA探针的芯片进行杂交,筛选在喉鳞癌和癌旁正常组织中差异表达的miRNA。结果:喉鳞癌及癌旁组织中提取的总RNA均符合芯片杂交要求,RNA完整性评分1.8~2.1;共有132个miRNA在8例喉鳞癌患者中均有表达。喉鳞癌和癌旁正常组织中差异表达的miRNA有53个,其中22个出现上调,31个出现下调,差异表达≥5倍的miRNA共有8个,上调的有miR-196b、miR-196a、miR-7和miR-183,下调的有miR-375、miR-139-5p、miR-338-3p和miR-370,其中miR-196b、miR-196a和miR-375差异表达≥8倍。采用TargetScan、Pictar、miRanda和MirTarget2等4种算法数据库预测这8种差异表达的miRNA的靶基因,4种数据库中均预测到的靶基因共183个。结论:通过基因芯片的方法,筛选到喉鳞癌和癌旁组织中差异表达的miRNA,对其中明显差异表达的miRNA及其靶基因的深入研究有可能找到新的喉鳞癌分子肿瘤学标志,为进一步研究喉鳞癌发病机制打下基础。
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