口蹄疫病毒OT株的全基因组序列测定及比较分析

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:stanley_lippman
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参考GenBank上已发表的口蹄疫病毒(FMDV)全长基因组序列,设计了覆盖基因组全长的数对引物,通过RT-PCR方法对口蹄疫病毒0T株进行分段克隆及序列测定。结果表明不含poly(C)序列的0T株基因组全序列长8142nt,开放读码框(0RF)长6969nt、编码2322aa,5,UTR长1004nt,3’UTR长93nt,3’UTR之后为23nt的poly(A)尾巴。应用分子生物学软件将OT株与FMDV其它参考毒株进行序列比对,并对其基因特征进行分析。结果显示,OT株的假结节(Pseudoknots)
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