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针对陕西省白河县不同地区的光皮木瓜采用高效液相色谱法（HPLC）建立的10个不同地区光皮木瓜指纹图谱进行研究，对所获得的数据信息进行数据化处理；分析样品的相似度，用聚类分析法对不同产地光皮木瓜样品进行分析和合理的归类，将其样品分为3类，建立了木瓜的指纹图谱共有模型，找出了较大的11个共有峰。通过HPLC指纹图和聚类分析法，建立了控制光皮木瓜质量的新方法。