近几年来,随着高校科研经费呈迅速增长的趋势,财务部门对科研经费的监督和管理越来越重要.2016年中共中央办公厅、国务院办公厅印发了《关于进一步完善中央财政科研项目资金管理等政策的若干意见》,要求高校做好科研经费“放管服”工作.高校财务部门既要管理好科研经费,又要给予科研教师充分的自主权.根据“放管服”的要求,财务部门相继制定了一系列务实的规定,通过改革和创新科研经费管理和使用方式,为教师创造良好的科研环境.本文剖析了学校科研经费核算中存在的问题和不足,认为在“两个沟通和一个制度”方面有待完善,“两个沟通”就是职能部门之间信息沟通以及财务人员与科研教师在科研活动与经费管理上沟通交流;“一个制度”就是健全科研财务助理制度.提出财务部门应该通过加强部门协同联动,实现与科研部门的科研信息系统、资产管理部门的“设备全生命周期管理”系统的数据对接,建立“大系统”管理观念;通过财务部门网上自助报销系统,推动国内差旅平台的使用;建立科研财务助理制度等手段,完善“两个沟通,一个制度”,使科研活动的顺利开展与科研经费管理能够有序并进.