【摘 要】
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转录组学研究近几年成为生命科学和医学领域的研究热点，基因表达水平测量则是转录组学研究的基础。差异基因表达分析对于了解基因功能具有重要作用，而差异异构体表达分析则能够
【机 构】
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南京航空航天大学计算机科学与技术学院,南京林业大学信息科学技术学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(61170152)
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转录组学研究近几年成为生命科学和医学领域的研究热点，基因表达水平测量则是转录组学研究的基础。差异基因表达分析对于了解基因功能具有重要作用，而差异异构体表达分析则能够反映选择性剪切变化的情况。当前大规模测量基因表达水平的实验平台主要包括基因芯片，以及基于高通量测序技术的RNA-Seq。首先介绍广泛使用的Affymetrix传统3’基因芯片、外显子芯片、较新的全转录组芯片，以及基于RNA-Seq技术的Illumina平台4个主流实验平台的技术原理；其次从基因表达水平计算和差异表达分析两方面介绍每个平台下一些主
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