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针对植物根系XCT图像提出了一种基于Canny算子的边缘检测组合分割算法。该方法分为3步:第1步通过图像预处理实现对原始数据的格式转换、滤波去噪、亮度校正及三维数据封装;第2步是采用Canny算子进行边缘检测得到根系组织的闭合边缘;第3步是通过种子填充、形态学修正、孔洞填充等算法实现根系组织的分割和提取。结果表明:采用本文提出的组合分割算法,能够原位地分割和提取出生长在土壤介质中的根系组织,并保留了分割区域内部的完整信息。