【摘 要】
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红花檵木花红叶艳、耐修剪、抗逆性强和生态适应性广，广泛的应用于城市绿化和园林美化，也是重要的中药材。但其分子生物研究进展缓慢，红花檵木全基因组的破译能为其花色、叶色、
【机 构】
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湖南农业大学园艺学院; 湖南省中亚热带优质花木繁育与利用工程中心; 中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 湖南农业大学风景园林与艺术设计学院;
【基金项目】
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湖南省科技计划(2018TP2007);湖南省科技厅重点研发计划项目(2016NK2100);湖南农业大学‘双一流’建设项目科学研究培育项目(SYL201802026, SYL2019012);湖南省教育厅项目(18B124);湖南农业大学第三批重大科研项目暨创新团队培育工程(201909)共同资助
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红花檵木花红叶艳、耐修剪、抗逆性强和生态适应性广，广泛的应用于城市绿化和园林美化，也是重要的中药材。但其分子生物研究进展缓慢，红花檵木全基因组的破译能为其花色、叶色、株型、主要功能成分代谢等方面的深入研究提供坚实的基础。本研究基于Illumina测序平台测定了红花檵木基因组，运用生物信息学的方法预测其基因组大小，分析了基因组的杂合度、重复序列情况、GC含量等基因组特征，并进一步用SOAP de novo软件进行了基因组的组装。研究表明：红花檵木基因组大小的校正值为2.87 GB；红花檵木基因组具有高重复序列和低杂合的特点，重复序列比率为76.32 %，杂合率为0.20 %，GC含量为35.52 %；利用SOAP de novo软件对49.42 GB clean data进行了组装，得到4 333 224条Scaffold，拼接序列总长度为1504451854 bp，组装后得到的最长序列为26 254 bp，N50为528 bp，N90为133 bp，后续研究建议采用Illumina+ PacBio RSII测序技术相结合方式，辅以Hi-C技术及其相应的拼接组装软件，有望得较好的红花檵木全基因组图谱。
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1956年生于山东省烟台市，1983年毕业于山东艺术学院美术系，现为中国美术家协会会员，山东省政协常委，山东艺术学院教授，硕士研究生导师，美术学院副院长。