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鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的人畜共患传染病，其发生受包括气候因子在内的多种因素的影响。近年来有关气候因素对鼠疫影响的研究越来越多。研究表明，气候因素（主要是降雨量与气温）通过影响鼠疫宿主动物丰度和跳蚤指数进而影响鼠疫的发生与分布，而且气候对鼠疫流行动力学、鼠疫流行范围等都有影响。气候对中国南北方人间鼠疫的影响也有着明显的差异。在"独居达斡尔地松鼠-传播媒介-鼠疫"和"群居蒙古沙鼠-传播媒介-鼠疫"2个不同的鼠疫流行体系中，鼠疫宿主动物对气候变化的响应存在着明显的种群差异。虽然降雨量、跳蚤指数、啮齿动物密度与鼠疫之间的内部关系支持营养级联假说，但还不能证明鼠疫发生与降雨量之间存在明确的因果关系，所以气候因素对鼠疫分布的影响目前只能用于鼠疫的预测与预警。