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近年来许多与乳腺癌相关的微管相关蛋白(MAP)被发现或在乳腺癌治疗中有了更深入的研究。末端结合蛋白1(EB1)蛋白能促进乳腺癌细胞的增殖，对乳腺癌具有致癌作用并影响乳腺癌治疗的化疗敏感性。含有MAP7功能域的蛋白3(Mdp3)表达在乳腺癌上皮细胞中，对其生长和转移具有重要作用。核仁纺锤体相关蛋白(NuSAP)基因在乳腺癌组织中的表达上调，可作为乳腺癌生物标志物。Tau蛋白表达水平与雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)及人类表皮生长因子受体-2(HER-2)表达水平相关，其对紫杉醇化疗和内分泌治疗患者疗效的影响仍具有较大争议性。