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双翅目昆虫为完全变态发育,多个物种幼虫和蛹形态相似、同一物种不同发育阶段数据缺乏等问题都为双翅目昆虫的物种鉴定带来困扰.DNA条形码技术的有效性已被证实,广泛应用于分类学等多个领域.DNA条形码技术不可能完全取代形态学分类方法，它可以作为形态学鉴定的辅助工具，为传统的物种鉴定提供分子依据．也就是说，将形态学分类与分子分类相结合，会使物种鉴定结果更科学更准确，这是分类学发展的方向．目前交叉学科的兴起和发展为众多领域带来生机，DNA条形码技术可结合生态学、系统学、法医学、动物行为学、进化生物学、生物地理学等学科，利用学科互补开拓新的研究领域．