【摘 要】
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食物中的蛋白质是最常见的食入性致敏原。为了对水稻中的内源性致敏原有一个全面的认识和了解,本研究利用全序列比对的方法比较了水稻蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得
【机 构】
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海南大学农学院,中国热带农业科学院热带生物技术研究所,
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食物中的蛋白质是最常见的食入性致敏原。为了对水稻中的内源性致敏原有一个全面的认识和了解,本研究利用全序列比对的方法比较了水稻蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得了水稻潜在致敏原,并对其保守结构域、分子功能、系统发育和染色体分布进行了分析和描述。结果一共发现了122个水稻潜在致敏蛋白,其中包括了22个已被数据库收录的水稻致敏原;保守结构域分析显示它们分别属于37个蛋白家族,其中的HATPase_c_3(Histidine kinase-,DNA gyrase B-,and HSP90-like ATPase,PF13589)结构域未在已知致敏原中发现;系统发育分析则分别揭示了水稻Prolamin蛋白超家族和Dna K蛋白家族的多样性;而且潜在致敏蛋白在水稻染色体上有成簇状分布的趋势。
The protein in food is the most common ingestion of allergens. In order to provide a comprehensive understanding and understanding of the endogenous allergens in rice, this study compared the sequence similarity between the rice protein and the known allergens by using the method of full sequence alignment, Minyuan, and analyzed its conservative domain, molecular function, phylogeny and chromosome distribution. Results A total of 122 potential allergens were found in rice, including 22 rice allergens which have been included in the database. The conserved domain analysis showed that they belong to 37 protein families, including HATPase_c_3 (DNA gyrase) B, and HSP90-like ATPase (PF13589) domains were not found in the known allergens. Phylogenetic analysis revealed the diversity of the rice Prolamin protein family and the Dna K protein family, respectively. Moreover, Rice chromosomes have the trend of clustered distribution.
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