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以黑龙江省大豆为材料,利用正交试验设计,对大豆ISSR-PCR反应体系中的5种主要因素（Mg2＋、引物、dNTPs、模板DNA量、Taq酶量）在4个水平上进行体系优化。结果确定了大豆ISSR-PCR反应的最佳体系（25μL）为：Mg2＋浓度1.85mmol·L^-1、dNTPs浓度1.2mmol·L^-1、引物浓度1.2μmol·L^-1、模板DNA60ng、Taq酶量0.7U。利用该最佳体系,选取引物855对25份材料进行扩增,以验证该体系的稳定性。建立了适于大豆的ISSR