丙型肝炎病毒山东分离株核衣壳蛋白区cDNA的序列测定

来源 :青岛医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hlucjx
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①目的 通过核衣壳蛋白区( C区)基因序列分析,对丙型肝炎病毒( H C V)山东分离株进行定型。②方法 应用反转录套式聚合酶链反应( R Tnested P C R)方法,从山东省 H C V 抗体阳性血清中扩增出 H C V C区基因的一个片段(432bp),对其进行 T A 克隆及测序,并通过 D N A S I S软件和 Genebank 进行序列分析。③结果 此分离株与基因型1b 的 H C V 分离株同源性最高,与4 个已知 1b 型分离株的核苷酸相应序列同源性为 96.528% ~98.144% ,其推导的氨基酸同源性为94.444% ~96.032% .④结论 此分离株归为 1b 型。 ① Objective To identify the hepatitis C virus (H C V) Shandong isolates by sequence analysis of the nucleocapsid protein region (C region). Methods A fragment (432 bp) of H C V C gene was amplified from HCV positive sera of Shandong Province by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) T A was cloned and sequenced and sequenced by D N A S I S software and Genebank. (3) The results showed that this isolate had the highest homology with the H C V isolates of genotype 1b, and had 96.528% -98.144% homology with the corresponding nucleotide sequences of 4 known type 1b isolates The deduced amino acid homology was 94.444% ~ 96.032%. ④ Conclusion This strain is classified as type 1b.
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