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以黑珍珠莲雾为试材,对ISSR反应体系中的各个主要影响因子进行了优化筛选,结果表明,25μLISSR反应体系各组分的最适浓度分别为:1×Buffer(不含Mg2+)、2.0 mmol/L Mg2+、0.2 mmol/L dNTPs、Taq DNA聚合酶1.5 U、引物0.2μmol/L、模板1.0 ng/μL.此外,加入1.6%的甲酰胺有利于减轻背景噪音的干扰.并利用该优化体系对12个连雾类型和2个近缘种进行了ISSR扩增,证实了该体系稳定可靠.