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差减杂交技术是一种用于寻找基因组之间差异的有效的方法。其通过去除被比较的两组基因组之间的共有序列，富集差异序列的方法来达到寻找差异基因的目的。其操作简便，价格低廉，且避免了已知细菌基因组信息匮乏对其应用的限制，从而在细菌学方面得到了广泛的应用，包括鉴定可能与毒力有关的致病基因岛／遗传岛、查找细菌的致弱机理、鉴定可移动的遗传成分、寻找毒力基因、寻找与导致宿主差异有关的基因、检测基因表达上的变化等多个方面。从而为病原的鉴定，疾病的诊断，预防，细菌的致病机理等方面的研究奠定了坚实的基础。